W przypadku alergii pokarmowej, najskuteczniejsza okazuje się dieta eliminacyjna. Wówczas należy wykluczyć z jadłospisu wszystkie produkty, które zawierają alergen. Niekiedy taką dietę należy stosować przez całe życie. Często jednak jest to dieta tymczasowa, zwłaszcza w przypadku dzieci. Czasem alergia może samoistnie zaniknąć, głównie po prawidłowym ukształtowaniu układu immunologicznego.
Będąc na diecie eliminacyjnej, należy dokładnie czytać wszelkie etykiety. Często poszczególne produkty mogą bowiem w śladowych ilościach zawierać alergizujący składnik. W przypadku mleka, takimi produktami mogą być ciasta, makarony, niektóre sosy, pyzy.
Matki karmiące piersią powinny zmodyfikować swoją dietę, z wykluczeniem składnika uczulającego dziecko. Jeżeli niemowlę karmione jest sztucznym mlekiem, warto wybrać takie preparaty, które cechują się dużym stopniem hydrolizy białka.
Czasem dieta eliminacyjna może nie być wystarczająca, żeby zwalczyć wszystkie objawy. Wówczas należy zastosować leczenie farmakologiczne. Najczęściej polega ono na podawaniu leków przeciwhistaminowych oraz glikokorytkosteroidów.